亚洲欧洲自拍-亚洲欧洲在线视频-亚洲欧洲在线观看-亚洲欧洲尹人香蕉综合-亚洲欧洲一区二区三区在线观看-亚洲欧洲一区二区三区在线

產(chǎn)品展示
PRODUCT DISPLAY
聯(lián)系方式

電話:
021-67610176傳真:

行業(yè)資訊您現(xiàn)在的位置:首頁 > 行業(yè)資訊 > 采用SMRT測序技術(shù)獲得 NCTC 3,000株細(xì)菌基因組圖譜
采用SMRT測序技術(shù)獲得 NCTC 3,000株細(xì)菌基因組圖譜
  • 發(fā)布日期:2018-06-14      瀏覽次數(shù):1690
    • 英國的Wellcome Sanger研究所Pacific Biosciences(PacBio)合作已完成了對英國公共衛(wèi)生部國家標(biāo)準(zhǔn)菌庫NCTC中 3,000多株細(xì)菌的基因組的測序工作,其中包括一些世界上的細(xì)菌,如引起鼠疫、痢疾和霍亂的細(xì)菌。通過解碼DNA,研究人員能夠更好地了解細(xì)菌引起的疾病以及它們?nèi)绾涡纬赡退幮浴_@些公開的基因組圖譜也有助于人們開發(fā)新型的診斷檢測、疫苗或治療方案。

       

      其中的2700多株細(xì)菌,超過56%的細(xì)菌株實(shí)現(xiàn)單個(gè)Contig組裝,超過92%的細(xì)菌株實(shí)現(xiàn)少于5個(gè)Contig組裝。

      ——小編評語

      NCTC 3000這項(xiàng)合作項(xiàng)目始于2013年,旨在對建于1920年代的NCTC貯存的5500多種細(xì)菌中3000多株細(xì)菌進(jìn)行全基因組測序。NCTC是世界上大的菌庫之一,收集了多種臨床相關(guān)致病菌株,包括的耐受多重抗生素的超級細(xì)菌—耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)的樣本。此外,NCTC還保藏了很多有歷史意義的菌株,包括青霉素發(fā)現(xiàn)者Alexander Fleming存放的16株菌株,其中一個(gè)樣本是從他的鼻子中獲得的。還有一株是1915年從一戰(zhàn)的士兵身上分離出來的引起痢疾的福氏志賀菌(Shigella flexneri)。 NCTC作為生物資源中心,為生物基礎(chǔ)及臨床研究提供已知種源地的菌株。此前,NCTC的大多數(shù)菌株都沒有參考基因組,這嚴(yán)重制約了NCTC菌株在研究中的參考應(yīng)用。

       

       

      PacBio SMRT測序技術(shù)作為長讀長測序技術(shù)的者,其擁有測序讀長長、一致性準(zhǔn)確度高、無PCR擴(kuò)增進(jìn)而全基因組均勻覆蓋、在測序的同時(shí)獲得堿基修飾信息等技術(shù)優(yōu)勢,這些優(yōu)勢讓NCTC與PacBio達(dá)成NCTC 3000這項(xiàng)合作項(xiàng)目。

       

       

      PacBio SMRT測序技術(shù)目前已成為微生物測序領(lǐng)域業(yè)界*的金標(biāo)準(zhǔn)測序技術(shù),這一技術(shù)可以通過1次實(shí)驗(yàn)獲取3種信息。

      1

      金標(biāo)準(zhǔn)級參考基因組,獲得基因組完成圖

      2

      能夠?qū)λ|(zhì)粒進(jìn)行組裝,追溯質(zhì)粒水平轉(zhuǎn)移現(xiàn)象;定位功能基因(耐藥或毒性基因)、可移動(dòng)元件在基因組上的位置

      3

      測序的同時(shí)可獲取堿基修飾信息

       

      目前,抗生素耐藥性是的一個(gè)重大問題。一些耐藥性細(xì)菌引起了嚴(yán)重疾病,包括死因之一的結(jié)核病,僅在2016年就感染了1040萬人,并造成170萬人死亡;此外,還有淋病,這是一種每年感染7800萬人的性傳播疾病,世界衛(wèi)生組織稱這種疾病幾乎是不可治愈的。

       

      研究人員對NCTC保藏的所有“標(biāo)準(zhǔn)菌株(type strain)”進(jìn)行了測序。這些菌株的遺傳學(xué)研究將有助于研究人員了解抗生素耐藥機(jī)制,開發(fā)新型的治療方案;有助于人們開發(fā)新方法來鑒定感染,包括在現(xiàn)場快速診斷細(xì)菌感染,以便確定疾病爆發(fā)的源頭并幫助控制感染。

       

      Sanger研究所的Julian Parkhill表示“NCTC的菌種保藏對于了解現(xiàn)在的病原體意義重大。準(zhǔn)確地了解抗生素和疫苗引入前后細(xì)菌的變化,并將它們與現(xiàn)在的菌株進(jìn)行比較,這將有利于我們了解細(xì)菌產(chǎn)生耐藥性的機(jī)制。反過來,這也幫助我們開發(fā)新型的抗生素和疫苗,PacBio全面的DNA測序?qū)崿F(xiàn)了深入的基因組分析,我們很高興與他們合作開展這一重要項(xiàng)目。”

       

      PacBio的科學(xué)官Jonas Korlach表示“SMRT測序所帶來的高質(zhì)量基因組圖譜讓人們對這些細(xì)菌有了的了解。我們很高興能被Sanger研究所等機(jī)構(gòu)選中,為科學(xué)界和公共衛(wèi)生界創(chuàng)造了如此重要的資源。”

       

      英國公共衛(wèi)生部Julie Russell博士表示“NCTC 3000是公共衛(wèi)生的重要資源,通過對細(xì)菌進(jìn)行測序,我們已經(jīng)使得NCTC菌株系列更好地為21世紀(jì)服務(wù),以便研究界能夠跟蹤和了解細(xì)菌。 通過這個(gè)系列,我們可以跟蹤細(xì)菌的感染、識別耐藥細(xì)菌的爆發(fā),改進(jìn)英國的公共健康。”

    魏經(jīng)理
    • 手機(jī)

      13224517959

    主站蜘蛛池模板: 日韩色综合 | 亚洲福利一区二区精品秒拍 | 亚洲狠狠网站色噜噜 | 国产精品成人一区二区1 | 国产精品视频二区不卡 | 久久毛片免费看一区二区三区 | 国产永久免费视频m3u8 | 国产绿帽 | 国产亚洲精aa在线观看香蕉 | 99久久精品国产片久人 | 超级乱淫寡妇 | 亚欧有色在线观看免费版高清 | 女王调奴丨vk | 精品久久久久久久久久久 | 国产成人精品s8sp视频 | 好大好硬好深好爽gif图 | 无码精品AV久久久奶水 | 99re这里只有精品视频在线观看 | 欧美一卡2卡3卡无卡 | 麻麻与子乱肉小说怀孕 | 欧美一区二区视频 | 99热在线这里只有精品 | 欧美高清videosdesex0 | 色人阁导航 | 丝瓜视频在线观看污 | 精品国产麻豆免费人成网站 | www.日日操 | 欧美日韩视频在线第一区二区三区 | 人人擦 | 精品国产区一区二区三区在线观看 | 成年人在线观看视频免费 | 午夜特级毛片 | 九九99香蕉在线视频免费 | 久久免费资源福利资源站 | 韩国漂亮美女三级在线观看 | 久久这里只有精品国产精品99 | 亚州综合网 | 午夜久久久久久网站 | 大伊香蕉精品二区视频在线 | 日本漫画无翼乌 | 国产成人精品一区二三区在线观看 |